Sobre a ciência do metabolismo 1o e 2o.

APPROVED NEW THEMATIC GRANT FUNDED BY FAPESP

Anunciamos a aprovação pela FAPESP de financiamento de projeto temático por um período de cinco anos a partir do início de 2021, “A Função da Química na Adaptação de Holobiontes”.
Um holobionte é constituído por um hospedeiro e toda a sua comunidade ecológica de micro-organismos associados. Uma característica ainda pouco compreendida é a função de metabólitos secundários em relações micro-organismos/hospedeiro, bem como em interações mediadas quimicamente entre holobiontes (o conjunto micro-organismos-hospedeiro) e o ambiente.

A: Tambja brasiliensis alimentando-se de Virididentula dentata; B: Tambja stegosauriformis alimentando-se de V. dentata; C: Roboastra ernsti predando T. stegosauriformis.

Durante o desenvolvimento do projeto objetiva-se investigar:
– aspectos selecionados à química de esponjas marinhas e como a química influencia no sucesso evolutivo de esponjas marinhas;
– como micro-organismos estão envolvidos na transferência de metabólitos entre presas e predadores no ambiente marinho;
– a química de grupos selecionados de invertebrados marinhos e de micro-organismos associados a invertebrados e plantas, com o objetivo de obter novos produtos químicos bioativos;
– explorar a química e a biologia de compostos farmacologicamente ativos já obtidos e identificados, a fim de sintetizar quimicamente compostos com atividade mais potente e seletiva e estruturalmente menos complexos, com o objetivo de explorar a biologia desses compostos em células cancerígenas, bem como em doenças infecciosas parasitárias e microbianas;
– investigar a biossíntese de grupos selecionados de metabólitos de micro-organismos, com o objetivo de desvendar clusters de genes e enzimas envolvidas nas etapas de biossíntese e propor modificações estruturais utilizando bioengenharia genética, objetivando melhorar a atividade biológica dos compostos investigados;
– desenvolver uma abordagem para a seleção automatizada de microrganismos.
O objetivo final é responder a perguntas desafiadoras, de maneira a avançar no conhecimento da adaptação de holobiontes e explorar substâncias químicas úteis que influenciam a adaptação dos holobiontes e que resultam do sucesso dos holobiontes na Natureza.
Alunos de todos os níveis são convidados a entrar em contato com qualquer membro da equipe para participação no projeto como pesquisadores de iniciação científica, mestrado, doutorado ou de pós-doutorado. Aceitam-se candidaturas para bolsas financiadas pela Agência de Financiamento do Estado de São Paulo (FAPESP).

We announce the approval of a FAPESP-funded thematic grant project for a five years period, “The Role of Chemistry in Holobiont Adaptation”.
A holobiont is constituted by a host and its whole ecological community of associated microbes. It is a unit of evolution, and the holobiont selection is a major evolutionary force. One feature which it is still poorly addressed is the role of secondary metabolites in microbes-host relationships, as well as in chemically mediated interactions between holobionts (the microbes-host ensemble) and the environment.
In this proposal, we aim to investigate:
– selected aspects of marine sponge holobiont chemistry and how the chemistry is implied in marine sponge success;
– how microbes are involved in chemistry transfer from preys to predators in the marine environment;
– the chemistry of selected groups of marine invertebrates and of microbes associated with invertebrates and plants, aiming to obtain novel bioactive chemicals;
– to further explore the chemistry and biology of already obtained lead compounds, in order to design more active and structurally less complex bioactive scaffolds, aiming to further explore the pharmacology of these compounds related to cancer as well as to parasitic and microbial infectious diseases;
– to investigate the biosynthesis of selected groups of microbial metabolites, in order to unveil gene clusters and enzymes involved in biosynthetic steps and to envisage bioengineered structural modifications to improve biological activity;
– to develop an unprecedented approach for the automated selection of microorganisms.
The ultimate aim is to answer challenging questions, in order to advance the knowledge of holobionts adaptation, and to explore useful chemicals that influence holobionts adaptation and that result from holobionts success in Nature.
Students of all levels are invited to contact any member of the team for supervision and participation as Undergraduate Investigators, MSc and PhD students or as post-doctoral researchers. Applications to scholarships funded by the São Paulo State Funding Agency (FAPESP) are welcome.

Equipe de Pesquisadores do Projeto (Research Team)
Coordenação (Lead PI): Roberto G. S. Berlinck (Instituto de Química de São Carlos, USP)
Antônio G. Ferreira (Departamento de Química, UFSCar)
Camila M. Crnkovic (Faculdade de Ciências Farmacêuticas, USP)
Danilo C. Miguel (Instituto de Biologia, UNICAMP)
Eduardo Hajdu (Museu Nacional, UFRJ)
Rafael Guido (Instituto de Física de São Carlos, USP)
Fernanda F. Cavalcanti (Departamento de Biologia, UFBA)
Fernanda Gadelha (Instituto de Biologia, UNICAMP)
Leandro M. Vieira (Departamento de Zoologia, UFPE)
Marcelo Brocchi (Instituto de Biologia, UNICAMP)
Igor D. Jurberg (Instituto de Química, UNICAMP)
Raquel A. dos Santos (UNIFRAN)
Ricardo M. Marcacini (Instituto de Ciências Matemáticas e da Computação, USP)
Ronaldo A. Pilli (Instituto de Química, UNICAMP)
Rosana M. Rocha (Departamento de Zoologia, UFPR)
Severino M. Alencar (ESALQ, USP)
Simone P. Lira (Departamento de Ciências Exatas, ESALQ, USP)
Solange Rezende (Instituto de Ciências Matemáticas e da Computação, USP)
Taicia Fill (Instituto de Química, UNICAMP)
Tiago Venâncio (Departamento de Química, UFSCar)
Vinicius Padula (Museu Nacional, UFRJ)

Colaboradores Internacionais (Internacional collaborators)
Alessandra S. Eustáquio (College of Pharmacy, University of Illinois, Chicago, USA)
Andréa Dessen (Institut de Biologie Structurale, Grenoble, França)
Daniel Romo (Department of Chemistry, Baylor University, USA)
George Chlipala (Associate Director, Research Informatics Core, Research Resources Center, University of Illinois at Chicago, USA)
Gustavo E. A. P. A. Batista (School of Computer Science and Engineering, University of New South Wales, Sydney, Australia)
Mark Maienschein-Cline (Director, Research Informatics Core, Research Resources Center, University of Illinois at Chicago, USA)
Raymond J. Andersen (Department of Chemistry and Department of Ocean, Earth and Atmospheric Sciences, University of British Columbia, Vancouver, Canada)
Roger Linington (Department of Chemistry, Simon Fraser University)
Stefan J. Green (Director | Sequencing Core, Associate Director | Research Resources Center, Affiliate Assistant Professor | Department of Biological Sciences, University of Illinois, Chicago, USA)

Ataques à ciência dão errado

A ciência é um conjunto institucionalizado de práticas de conhecimento, não um sistema filosófico.

O texto a seguir é uma tradução do texto “What Attacks on Science Get Wrong – Science is an institutionalized set of knowledge practices, not a philosophical system” publicado no The Chronicle of Higher Education em 9 de dezembro de 2020, de autoria de Andrew Jewett.

Andrew Jewett é autor de Science, Democracy, and the American University: From the Civil War to the Cold War (Cambridge University Press, 2012). Estudou em Harvard, Yale, New York University, Vanderbilt, e no Boston College. Teve bolsas de estudos do National Humanities Center, do Cornell Society for the Humanities, do National Academy of Education, e do American Academy of Arts and Sciences. Esse texto é adaptado do último livro de Jewett, Science under Fire: Challenges to Scientific Authority in Modern America (Harvard University Press).

Em 2013, eclodiu outra longa linha de disputas sobre o cientificismo. Leon Wieseltier, editor literário do The New Republic, disse aos formandos em humanidades em uma cerimônia de formatura da Universidade Brandeis que eles representavam “a resistência” em uma sociedade dominada pelos “imperialismos gêmeos da ciência e da tecnologia”. Wieseltier mencionou os temas familiares de ataque à ciência – a escravidão dos seres humanos às máquinas, a tirania dos números, as depredações do “tecnologismo”, o domínio incontestável da “utilidade, velocidade, eficiência e conveniência” na cultura moderna. O antídoto, afirmou ele, são as humanidades.

O psicólogo evolucionista Steven Pinker respondeu. Humanistas petulantes, acusou ele, dão boas-vindas à ciência quando ela cura doenças, mas não quando ela atinge seu feudo profissional. A marcha da ciência e do Iluminismo melhorou imensamente a condição humana. Apenas a ciência, insistiu Pinker, poderia abordar “as questões mais profundas sobre quem somos, de onde viemos e como definimos o significado e o propósito de nossas vidas”. Os estudiosos das ciências humanas permaneceriam irrelevantes até que adotassem o humanitarismo cientificamente informado que constituía a “moralidade de fato” do mundo moderno. A controvérsia que se seguiu se estendeu por aquele verão e outono.

Hoje, uma pandemia global atinge o mundo. As sociedades enfrentam questões imediatas, práticas, de vida ou morte, sobre como incorporar ciência e perícia em suas decisões coletivas. E, no entanto, os velhos refrões ainda podem ser ouvidos. O comentarista conservador Sohrab Ahmari argumentou que “a ideologia do cientificismo” mergulhou o mundo em “um funk meio-milênio”. Diante de um vírus mortal, escreveu Ahmari, os modernos não entendem por que “vale a pena viver e passar adiante”; eles não podem nem mesmo afirmar que “ser é preferível a não ser”. Pinker voltou a entrar na conversa, argumentando que as decisões políticas que favorecem o bem-estar econômico em vez da saúde física refletem a “ilusão maligna” da “crença na vida após a morte” dos evangélicos, que “desvaloriza vidas reais”.

E assim este padrão cansativo de décadas de disputas continua. Amargas controvérsias públicas giram em torno de mudanças climáticas, design inteligente, alimentos geneticamente modificados, vacinas, mineração de dados e dezenas de outras questões. Em resposta, os críticos culturais reiteram suas posições familiares – geralmente o lamento de que uma ciência sem alma domina a vida moderna ou o medo de que uma onda crescente de irracionalidade faça com que a humanidade retorne à idade das trevas. As abstrações proliferam, à medida que comentaristas invocam a ciência, o cientificismo, o racionalismo, o Iluminismo, as humanidades, o humanismo, a religião, a fé, a irracionalidade, o Ocidente e a modernidade.

Essas abstrações em grande escala provaram ser extremamente inúteis. Cada um dos problemas que enfrentamos tem seus próprios contornos distintos, suas próprias inter-relações complexas entre ciência e normas sociais, práticas e instituições. Apesar das declarações inflamadas dos combatentes e das preocupações dos espectadores, o empreendimento científico como um todo não está em jogo nos debates sobre vacinação, engenharia genética ou mudança climática. Em vez disso, essas controvérsias envolvem descobertas científicas específicas, teorias, técnicas, dispositivos e práticas, conforme se relacionam com valores profundamente arraigados (e muitas vezes diretamente conflitantes) de muitos grupos diferentes.

Teremos dificuldade para abordar as questões incômodas do século 21 se continuarmos a usar as ferramentas interpretativas dos séculos 19 e 20. Essas ferramentas foram forjadas na polêmica entre as elites culturais conflitantes sobre a extensão da ciência a novos domínios – primeiro na história da vida na Terra e depois nas relações humanas – e seu lugar em escolas e faculdades. As injunções gerais para colocar nossa confiança na ciência, ou religião, ou humanidades, ou qualquer outra estrutura ampla, oferecem pouca orientação sobre como responder às possibilidades sociais levantadas por inovações científicas específicas.

Em meados do século 20, uma grande variedade de líderes religiosos, juntamente com estudiosos das humanidades, conservadores políticos, muitos cientistas e grupos de cientistas sociais dissidentes e progressistas seculares, atribuíram os problemas do mundo moderno a uma difamação moral generalizada. Atribuíram esse problema, por sua vez, a tentativas equivocadas de aplicar métodos científicos ao domínio moralmente carregado da ação humana. As imagens resultantes da ciência como uma força eticamente impotente e culturalmente ameaçadora influenciaram as revoltas da década de 1960, que reforçaram poderosamente a associação da ciência com uma forma tecnocrática de liberalismo. Embora os contornos dessas imagens tenham mudado desde então, elas ajudam a explicar por que muitos americanos vêem a ciência moderna como uma presença cultural estranha, apesar de suas associações igualmente fortes com o progresso tecnológico e o crescimento econômico.

Os desafios à autoridade científica que circularam nos Estados Unidos desde os anos 1920 não estão todos errados. A ciência é um empreendimento confuso e totalmente humano, que não aborda e não pode abordar muitas das questões sociais e morais que enfrentamos. Mas muitos críticos vincularam esse ceticismo apropriado a afirmações extravagantes sobre as ambições dos cientistas para o futuro e a influência no presente.

Apesar de todos os seus insights, a ‘esquerda acadêmica’ de hoje também herda muitos desses maus hábitos interpretativos. Na década de 1980, os pós-estruturalistas argumentaram que a mudança social exigiria o desmantelamento não apenas da visão de mundo predominante, mas também do sentimento subjacente de que uma visão de mundo funcionaria para todos. Não houve respostas finais, apenas pessoas em conflito, travando suas lutas em domínios que iam desde os mais altos níveis de abstração filosófica até as formas mais básicas e mundanas de atividade diária.

Os ataques pós-estruturais aos valores universais propostos pela geração do pós-guerra ampliaram-se para uma crítica à ideia de universalidade. As reivindicações de universalidade eram consideradas meramente como representações de exercícios de poder. A campanha contra o universalismo identificou a ciência como uma espécie de metáfora, uma arma excepcionalmente potente para desarmar aqueles que resistiriam a outras operações de poder. Isso influenciou muito a maneira como os estudiosos pensavam sobre a ciência e seus significados sociais no final do século XX. As concepções foucaultianas de “poder / conhecimento”, a rejeição do essencialismo e universalismo e as afirmações do pós-estruturalismo sobre a centralidade do conflito convergiram em um desafio total à compreensão convencional da ciência.

Esses compromissos moldaram a ‘esquerda acadêmica’ à medida que sua influência cresceu nas décadas de 1980 e 1990. Novos estilos de crítica se juntaram aos antigos, e os pós-estruturalistas negaram que qualquer um pudesse alcançar o que o filósofo Thomas Nagel chamou de “visão de lugar nenhum” e a estudiosa feminista Donna Haraway chamou de “truque de deus”. Mesmo as formas de objetividade de baixo para cima adotadas por muitos marxistas e feministas na veia de Sandra Harding entraram em conflito com essa crítica. Haraway procurou fundamentar a capacidade de um insight genuíno em pontos de vista autoconscientemente parciais. Sem uma estrutura única e libertadora disponível, argumentou ela, uma série de “conhecimentos situados” ofereceu a única alternativa para a falsa objetividade da ciência dominante.

À medida que a presunção de universalidade – e, portanto, de uma estrutura moral comum – desapareceu, uma nova ênfase na diferença prevaleceu na ‘esquerda acadêmica’. “A cosmovisão pós-moderna acarreta a dissipação da objetividade”, escreveu Zygmunt Bauman, com “a lenta erosão do domínio outrora desfrutado pela ciência sobre todo o campo do conhecimento (legítimo)”, levando ao surgimento de múltiplos sistemas de verdade concorrentes.

Há muito a ser dito sobre esses relatos. Como tantos críticos antes deles, no entanto, os teóricos pós-estruturais muitas vezes vincularam os argumentos do senso comum sobre o caráter e os limites do conhecimento científico a retratos abrangentes e redutivos de sua influência hegemônica no mundo moderno. Eles afirmaram que a ciência como um todo reivindica a capacidade de responder a todas as perguntas e resolver todos os problemas. Eles também afirmaram que a ciência reina suprema nas sociedades modernas, determinando os contornos básicos de nosso pensamento. Finalmente, eles atribuíram uma série de problemas sociais específicos à influência cultural da ciência. Ao fazer isso, eles ecoaram gerações de críticos religiosos, humanistas e conservadores com visões sociais muito diferentes das suas.

A segunda dessas suposições – que a ciência dá o tom da cultura moderna – ancora o resto do argumento e merece um exame especial. Se a ciência não é culturalmente dominante, então ela não pode ter causado a ladainha de males atribuídos à ela. A ciência é realmente tão influente? Ou devemos culpá-la instintivamente? O que, exatamente, é científico sobre o nosso mundo?

Nos Estados Unidos, a ciência desempenha funções públicas importantes. Biólogos e físicos exercem formas de autoridade em tribunais que líderes religiosos e críticos literários não possuem. O Federal Reserve baseia-se em especialistas econômicos, não na Bíblia ou em Melville. A Agência de Proteção Ambiental segue sugestões das ciências naturais, o Departamento de Educação das ciências sociais. As escolas públicas de ensino médio podem ensinar darwinismo, mas não criacionismo ou design inteligente. Olhando para esses casos, podemos concluir que a ciência desfruta de uma posição privilegiada única na cultura pública americana.

No entanto, outros especialistas também compartilham desses privilégios. Contamos constantemente com o conhecimento de historiadores, jornalistas, juristas e testemunhas oculares, entre outros, embora não consideremos seu trabalho científico. A posição elevada da ciência acaba sendo em parte uma questão de exclusão seletiva: de acordo com a Primeira Emenda, as instituições públicas nos Estados Unidos se abstêm – com ou sem razão, de forma consistente ou inconsistente – de tratar os princípios teológicos como verdades estabelecidas. Enquanto isso, mesmo os mais fervorosos defensores da literatura e das artes raramente afirmam que oferecem formas de conhecimento que devem ser usadas em tribunais ou em decisões políticas.

Ironicamente, o distanciamento das instituições públicas das religiosas tornou muito mais fácil para os críticos religiosos e humanistas se posicionar contra a ciência, embora esse posicionamento às vezes tenha prejudicado a capacidade de encontrar uma audiência. À medida que as comunidades religiosas se tornavam mais tolerantes umas com as outras, o inimigo comum – antigamente paganismo, agora materialismo, naturalismo ou secularismo – apresentava um alvo óbvio. Certamente, continua o pensamento, as instituições seculares resultam de filosofias seculares, e certamente a ciência produz essas filosofias. À medida que os cientistas aumentavam suas afirmações de neutralidade de valor, mais e mais críticos traçavam uma conexão causal. A ciência, eles argumentaram, trouxe à tona um mundo dominado por valores superficiais e materialistas, por uma mentalidade puramente instrumental que obscurece a própria existência de valores, ou talvez pelos valores de um grupo social hegemônico, pintado com o pincel da neutralidade.

É realmente verdade, entretanto, que as instituições e práticas seculares refletem o domínio cultural da ciência? Alguns países testemunharam a imposição ativa de visões de mundo “científicas” por regimes militantes seculares. No entanto, mesmo em tais casos, o conjunto institucionalizado de práticas de conhecimento que constituem a ciência não se alinhava necessariamente com as filosofias que marchavam sob sua bandeira. Nos Estados Unidos, as relações entre ciência, filosofia e secularização têm sido especialmente complexas e indiretas. É uma simplificação grosseira afirmar, como disse o estudioso de estudos religiosos Huston Smith, que a ciência “criou nosso mundo”. Ou ainda, como manifestou Alasdair MacIntyre, que a vida social contemporânea é em grande parte “a reencenação concreta e dramática da filosofia do século 18. ”

Muitas características do mundo moderno são seculares, mas não científicas. Direito, burocracia, capitalismo, consumismo, jornalismo, educação, esportes: essas esferas, como muitas outras, refletem em parte o declínio do controle das instituições religiosas. Mas eles não compartilham um único fundamento filosófico comum com a ciência. Como todas as formações sociais, cada uma toma muito de sua forma a partir de traços humanos antigos e de conflitos entre grupos específicos. E cada um, por sua vez, gera um conjunto distinto de suposições, valores e comportamentos culturais.

Isso não quer dizer que as pressuposições fundamentais sejam irrelevantes. A maioria das práticas e instituições no Ocidente moderno parecem inúteis ou mesmo prejudiciais para aqueles que presumem que uma divindade determina nossa sorte mundana, que nossas ações terrenas importam principalmente em relação ao nosso destino de outro mundo, ou ambos. Os padrões típicos de esforço nas sociedades modernas se encaixam muito melhor com a visão de que o bem-estar terreno de uma pessoa reflete em grande parte as ações terrenas de uma pessoa, e que essas ações importam principalmente por esse motivo.

Embora a difusão dessa ênfase no aqui e agora tenha tido grandes consequências, ela não é secular nem científica em si. Claro, isso é típico entre não teístas, embora alguns considerem a ação humana essencialmente sem sentido. Mas também se adapta a uma ampla gama de entendimentos religiosos, mesmo quando entra em conflito com outros. Na verdade, um dos pontos de discórdia em muitos debates em torno da ciência e da modernidade é a legitimidade dessas formas comparativamente mundanas de religião.

Existem questões importantes em jogo aqui, com consequências reais. Existe um Deus que intervém em nossos assuntos? Nosso sistema educacional deve enfatizar a biologia, a literatura ou a Bíblia? As respostas são muito importantes. Mas a forma como estruturamos nossos argumentos também é importante. É injusto e socialmente prejudicial empurrar todos os resultados da fragilidade humana para os livros de nossos oponentes. Essa abordagem gera ressentimento e desconfiança, incluindo ceticismo em relação aos nossos próprios programas culturais quando fica claro que exageramos os efeitos do mundo real das perspectivas concorrentes – e que a nossa perspectiva também não é a cura para as fraquezas humanas.

Enquanto isso, procurar enxergar os problemas sociais até as divergências filosóficas nos deixa incapazes de abordar esses problemas por conta própria, tanto por representar erroneamente suas causas principais quanto por nos convencer de que devemos confrontar nossos conflitos intelectuais antes de podermos tomar medidas significativas. Sem exagerar o grau de terreno compartilhado, devemos trabalhar para construir coalizões onde for possível, mesmo se acreditarmos que nossas próprias opiniões irão brilhar no final. Muitas das ideias que moldam profundamente o comportamento social – ideias sobre igualdade racial, por exemplo, ou a necessidade de regulamentação econômica – ultrapassam as perspectivas religiosas e seculares. Nossos padrões concorrentes de apologética não devem impedir a ação coletiva nessas áreas.

Os apologetas da ciência, como seus críticos, muitas vezes foram a extremos absurdos para desacreditar as visões de mundo que consideravam prejudiciais. Mas aqui é importante distinguir entre a ciência como um conjunto de práticas e instituições e as filosofias que vieram com seu nome. Os críticos da ciência costumam dar o passo salutar de diferenciar a ciência das filosofias do materialismo, naturalismo, positivismo e assim por diante. Mas fazem isso de uma maneira que coloca práticas científicas altamente valorizadas em seu próprio lado da linha filosófica e culpa os males do mundo em perspectivas orientadas para a ciência. Seria sensato adotar uma abordagem mais justa.

Tal abordagem insistiria em níveis diferenciados de análise. Há três histórias distintas a serem contadas: uma sobre os papéis sociais das práticas e descobertas científicas, uma segunda sobre as trajetórias e emaranhados de filosofias inspiradas na ciência e uma terceira sobre o desenvolvimento de padrões e instituições seculares. Insistir nessa diferenciação não é afirmar que a ciência é intrinsecamente pura, operando em glorioso isolamento do mundo humano. No entanto, distinguir entre ciência, filosofia e o secular, em vez de confundi-los, nos permitiria entender seus emaranhados históricos mais claramente – e lidar com mais eficácia com as implicações da pesquisa empírica em nossos dias.

Com o tempo, uma avaliação mais generosa e matizada da ciência pode nos ajudar a libertar os pesquisadores das afirmações extravagantes de desinteresse que envolvem seu trabalho. Não são apenas suas reivindicações, mas também os argumentos e ações de muitos outros grupos que aprisionaram os cientistas na jaula da absoluta neutralidade de valor. Os críticos frequentemente declaram que a ciência evita considerações de valor, a fim de culpá-la por isso. Alguns até afirmam que a ciência genuína fornece conhecimento absolutamente certo – não modelos, nem probabilidades, nem cálculos de risco – e deve fazê-lo antes de agirmos sobre ela. A maioria de nós é cúmplice de uma versão disso: quando confrontados com pesquisas de que não gostamos, exigimos que os pesquisadores em questão demonstrem seu completo desinteresse antes de levá-los a sério.

Esse ciclo deve ser quebrado se quisermos reconhecer a ciência pelo que ela realmente é: uma prática inteiramente humana como qualquer outra, mas que produz resultados notáveis. Em vez de argumentar que a validade da ciência depende da neutralidade pessoal de pesquisadores individuais, poderíamos aprender a valorizar as descobertas científicas por sua confiabilidade. Na verdade, poderíamos melhorar os procedimentos científicos adicionando novos recursos, como a participação do cidadão, para ajudar a garantir a confiabilidade dos resultados. Isso pode ser impossível se os críticos continuarem a ver a ciência como uma presença cultural monstruosa e culpá-la pelas falhas da humanidade, em vez de simplesmente avaliar seus pontos fortes e fracos. É hora de superar a polêmica, reconhecer que a ciência é uma característica central de nosso mundo e decidir o que faremos com ela.
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Veja o que dizem pesquisadores da NASA sobre a possível capacidade da ciência de entender tudo.

 

 

Oportunidades para Estudantes de Mestrado e Doutorado – Opportunities for MSc and PhD Students

Estão sendo oferecidas oportunidades para candidatos de pós-graduação para mestrado e/ou doutorado neste Grupo de Química Orgânica de Sistemas Biológicos.

O exame de avaliação pelo Instituto de Química de São Carlos será realizado no início de 2021, a ser divulgado em breve. Mantenha-se informado no link: http://www5.iqsc.usp.br/IQSC/pos-graduacao/

Candidatos com perfil acadêmico muito bom e sem reprovações têm oportunidade de solicitar bolsas FAPESP de mestrado e doutorado, com ingresso no Programa de Pós-Graduação do IQSC em fluxo contínuo.

Linhas de pesquisa incluem projetos que objetivam descobrir moléculas com atividade antibiótica contra bactérias patogênicas, atividade anti-Leishmania, anti-Chagas, anti-malária e anti-câncer. Estes são projetos colaborativos em química de produtos naturais e síntese orgânica (IQSC/UFSCar) e química de produtos naturais, síntese orgânica e química medicinal (IQSC/IFSC/UFSCar) com pesquisadores que desenvolvem bioensaios de investigação de mecanismo de ação na UNICAMP, Universidade de Franca e Institut de Biologie Structurale (Grenoble, França).

Projetos colaborativos também buscam desvendar a biossíntese de produtos naturais (IQSC/UNICAMP), desenvolver biotecnologia de produtos naturais (IQSC/FCF-USP-SP/ESALQ), e ferramentas para a descoberta de produtos naturais e automação com inteligência artificial (IQSC/ICMC).

Os projetos de pós-graduação são desenvolvidos com colaborações internacionais (University of British Columbia, Canada; University of Illinois, Chicago; University of Manchester; University of Hannover; Institut de Biologie Structurale (Grenoble, França)).

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Opportunities are being offered to graduate candidates for MSc and/or PHd degrees. The enrolment evaluation exam by the Institute of Chemistry of São Carlos will be held in early 2021. Keep posted at: http://www5.iqsc.usp.br/IQSC/pos-graduacao/

Candidates with a very good academic profile and no course failures will have the opportunity to apply for FAPESP scholarships, for admission to the IQSC Graduate Program in a continuous flow.

Research lines include projects that aim to discover compounds with antibiotic activity against pathogenic bacteria, anti-Leishmania, anti-Chagas, anti-malaria and anti-cancer activity. These are collaborative projects in chemistry of natural products and organic synthesis (IQSC / UFSCar) and chemistry of natural products, organic synthesis and medicinal chemistry (IQSC / IFSC / UFSCar) with researchers who develop bioassays with the investigation of mechanism of action at UNICAMP, Universidade de Franca and Institut de Biologie Structurale (Grenoble, France).

Collaborative projects also seek to unveil the biosynthesis of natural products (IQSC / UNICAMP), develop biotechnology of natural products (IQSC / FCF-USP-SP / ESALQ), and tools for the discovery of natural products and automation with artificial intelligence (IQSC / ICMC).

The projects are developed with international collaborations (University of British Columbia, Canada; University of Illinois, Chicago; University of Manchester; University of Hannover; Institut de Biologie Structurale (Grenoble, France)).

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Additional information can be requested to Professor Roberto Berlinck (rgsberlinck@iqsc.usp.br).

Curriculo Lattes/Lattes CV: http://lattes.cnpq.br/2392406298045396

See also: https://qosbioiqsc.blog/roberto-berlincks-research-group-1/

and

Recent articles – Dec 13th, 2018

From ACS Chemical Biology

Monoamine Biosynthesis via a Noncanonical Calcium-Activatable Aromatic Amino Acid Decarboxylase in Psilocybin Mushroom

From Science Magazine

Right Side, Left Side

Molecular to organismal chirality is induced by the conserved myosin 1D

From the Journal of Natural Products

Structural Revision of Macropodumine A and Structure of 2-Deoxymacropodumine A, Daphniphyllum Alkaloids with 11-Membered Macrolactone Rings

From The Journal of Organc Chemistry

Enantioselective Total Synthesis and Assignment of the Absolute Configuration of the Furo[3,2-a]carbazole Alkaloid Furoclausine-B

From The Journal of the American Chemical Society

Chemical Interventions for the Opioid Crisis: Key Advances and Remaining Challenges

From Marine Drugs

MS/MS-Based Molecular Networking Approach for the Detection of Aplysiatoxin-Related Compounds in Environmental Marine Cyanobacteria

From Nature

Ongoing challenge

Citations strength begins at home

An exciting tool for asymmetric synthesis

How snuggling close affects bats’ microbiome

From Organic Letters

Hypatulone A, a Homoadamantane-Type Acylphloroglucinol with an Intricately Caged Core from Hypericum patulum

Alterbrassicicene A, a Highly Transformed Fusicoccane-Derived Diterpenoid with Potent PPAR-γ Agonistic Activity from Alternaria brassicicola

With a pretty incredible biosynthesis proposal for these isoprene-derived natural products

Ophiorrhines A and B, Two Immunosuppressive Monoterpenoid Indole Alkaloids from Ophiorrhiza japonica

Alstoscholactine and Alstolaxepine, Monoterpenoid Indole Alkaloids with γ-Lactone-Bridged Cycloheptane and Oxepane Moieties from Alstonia scholaris

Biosynthesis of Quinolidomicin, the Largest Known Macrolide of Terrestrial Origin: Identification and Heterologous Expression of a Biosynthetic Gene Cluster over 200 kb

From Organic & Biomolecular Chemistry

Progress in total synthesis of subincanadine alkaloids and their congeners

Biosynthesis of the uridine-derived nucleoside antibiotic A-94964: Identification and characterization of the biosynthetic gene cluster provide insight into the biosynthetic pathway

Ciliatasecones A-C, three rearranged limonoids from Toona ciliata var. yunnanensis

Biosynthesis of an anti-tuberculosis sesterterpenoid asperterpenoid A

Meroterpene-like compounds derived from β-caryophyllene as potent α-glucosidase inhibitors

Crotonols A and B, two rare tigliane diterpenoid derivatives against K562 cells from Croton tiglium

Biosynthesis of lagopodins in mushroom involves complex network of oxidation reactions

From Angewandte Chemie International Edition

Guest Editorial: Critical Thinking in Education and Research—Why and How?

Nitromethane as a Carbanion Source for Domino Benzoannulation with Ynones: One‐Pot Synthesis of Polyfunctional Naphthalenes and a Total Synthesis of Macarpine

Towards the 150th anniversary of the Markovnikov’s rule

Insights into the Biosynthesis of Cyclic Guanidine Alkaloids from Crambeidae Marine Sponges

A Branched Diterpene Cascade: The Mechanism of Spinodiene Synthase from Saccharopolyspora spinosa

From the European Journal of Organic Chemistry

Stereoselective Syntheses of (+)‐Broussonetine D and (+)‐Australine via a Functionalized Pyrrolidine from an Extended Chiral 1,3‐Oxazine

News from the Brazilian Media – Dec 13th, 2018 – in Portuguese

Correios lançam selos especiais em homenagem a cientistas brasileiros em São Paulo

Ecossistema subterrâneo com bilhões de microorganismos é encontrado por cientistas

MEC deve apresentar ‘base curricular de professores’ nos próximos dias

Recent articles – Dec 9th, 2018

From the Journal of the American Chemical Society

Total Synthesis, Biological Evaluation, and Target Identification of Rare Abies Sesquiterpenoids

Enantioselective Synthesis of des-Epoxy-Amphidinolide N

Enantioselective Conversion of Oligoprenol Derivatives to Macrocycles in the Germacrene, Cembrene, and 18-Membered Cyclic Sesterterpene Series

Discovery and Characterization of 1-Aminocyclopropane-1-carboxylic Acid Synthase of Bacterial Origin

Adaptation of a Bacterial Multidrug Resistance System Revealed by the Structure and Function of AlbA

Total Synthesis of (−)-Mitrephorone A

Synthesis of Myrocin G, the Putative Active Form of the Myrocin Antitumor Antibiotics

Gramillin A and B: Cyclic Lipopeptides Identified as the Nonribosomal Biosynthetic Products of Fusarium graminearum

Progress Toward a Semi-Synthetic Organism with an Unrestricted Expanded Genetic Alphabet

This is an amazing paper.

From Nature

A chemical defence against phage infection

Do luxe labs shape science?

Does science have a bullying problem?

Ban bullying in science

How science supports São Paulo

Stop exploitation of foreign postdocs in the United States

Methicillin-resistant Staphylococcus aureus alters cell wall glycosylation to evade immunity

From Organic Letters

A Phenylpyruvic Acid Reductase Is Required for Biosynthesis of Tropane Alkaloids

Aspersecosteroids A and B, Two 11(9 → 10)-abeo-5,10-Secosteroids with a Dioxatetraheterocyclic Ring System from Aspergillus flocculosus 16D-1

Curtachalasins A and B, Two Cytochalasans with a Tetracyclic Skeleton from the Endophytic Fungus Xylaria curta E10

Antroalbocin A, an Antibacterial Sesquiterpenoid from Higher Fungus Antrodiella albocinnamomea

Genome Mining for Mycemycin: Discovery and Elucidation of Related Methylation and Chlorination Biosynthetic Chemistries

Seongsanamides A–D: Antiallergic Bicyclic Peptides from Bacillus safensis KCTC 12796BP

Vlasoulamine A, a Neuroprotective [3.2.2]Cyclazine Sesquiterpene Lactone Dimer from the Roots of Vladimiria souliei

Elucidation and Heterologous Reconstitution of Chrodrimanin B Biosynthesis

From Phytochemistry

Mulberry Diels-Alder-type adducts from Morus alba as multi-targeted agents for Alzheimer’s disease

Fusaricates H-K and fusolanones A-B from a mangrove endophytic fungus Fusarium solani HDN15-410

Recent articles – Dec 7th, 2018

From the Journal of Natural Products

Onydecalins, Fungal Polyketides with Anti-Histoplasma and Anti-TRP Activity

Isolation and Characterization of Anaephenes A–C, Alkylphenols from a Filamentous Cyanobacterium (Hormoscilla sp., Oscillatoriales)

Isotopic Labeling Studies Reveal the Patulin Detoxification Pathway by the Biocontrol Yeast Rhodotorula kratochvilovae LS11

Lentiquinones A, B, and C, Phytotoxic Anthraquinone Derivatives Isolated from Ascochyta lentis, a Pathogen of Lentil

Macrocyclic Trichothecene Mycotoxins from a Deadly Poisonous Mushroom, Podostroma cornu-damae

These findings are really interesting. Trichothecene polyketides are common metabolites produced by filamentous fungi. This mushroom appears to be the first basidiomycete for which isolation of trichothecenes have been reported. Are these truly mushroom metabolites, or maybe produced by a symbiotic fungus?

Elucidation of Relative and Absolute Configurations of Highly Rearranged Diterpenoids and Evidence for a Putative Biosynthetic Intermediate from the Australian Nudibranch Goniobranchus geometricus

From The Journal of Organic Chemistry

Vinyl-1,2,4-oxadiazoles Behave as Nucleophilic Partners in Morita–Baylis–Hillman Reactions

This is a paper from Professor Fernando Coelho’s group at the State University of Campinas, São Paulo, Brazil.

Porphyrins as Photoredox Catalysts in Csp2–H Arylations: Batch and Continuous Flow Approaches

This is a paper from Professor Kleber de Oliveira’s group at the Federal University of Sao Carlos, São Paulo, Brazil.

Asymmetric Total Synthesis and Evaluation of Antitumor Activity of Ophiorrhisine A and Its Derivatives

Total Synthesis of the Ortho-Hydroxylated Protoberberines (S)-Govaniadine, (S)-Caseamine, and (S)-Clarkeanidine via a Solvent-Directed Pictet–Spengler Reaction

Total Synthesis and Absolute Stereochemical Assignment of Microgrewiapine A and Its Stereoisomers

Enantioselective Total Synthesis of (+)-Nocardioazine B

Total Synthesis of (−)-Mucosin and Revision of Structure

From Nature Chemical Biology

Expanding the terpenoid kingdom

Identification of Chaoborus kairomone chemicals that induce defences in Daphnia

From Nature Chemistry

2018 NOBEL PRIZE IN CHEMISTRY – Exploiting evolution

From Chemical Society Reviews

Recent applications of C–H functionalization in complex natural product synthesis

From Natural Product Reports

Non-volatile natural products in plant glandular trichomes: chemistry, biological activities and biosynthesis

Nonribosomal antibacterial peptides that target multidrug-resistant bacteria

Science and Science Podcasts

The universe’s star formation history and a powerful new helper for evolution

The worst year ever and the effects of fasting

A systems biology approach to unravelling the complexities of immune system development and function

From the University of São Paulo newspaper (Jornal da USP)

Platform grants access to USP’s intellectual production since 1985

From Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

Tetradehydrohalicyclamine B, a new proteasome inhibitor from the marine sponge Acanthostrongylophora ingens

From Phytochemistry

Transport of organic substances through the cytoplasmic membrane of cyanobacteria

Recent Articles – Oct 6th, 2018

A Difficult Birth For Some Ideas

This fascinating article has nothing to do with drug discovery per se, but it has plenty to do with discovery itself. It’s a memoir of the author’s physicist grandfather, who believed while working at his job at Oak Ridge that he might have come across a big result in probability as related to quantum mechanics and physical law. Now, whether this idea is correct or not is the key question, and that’s still unanswered. One reason it’s still unanswered is that his paper trying to explain the idea went unpublished, again and again, a process that consumed a good part of the last years of his career… (read more, here).

My Grandfather Thought He Solved a Cosmic Mystery

When my grandfather died last fall, it fell to my sisters and me to sort through the books and papers in his home in East Tennessee. My grandfather was a nuclear physicist, my grandmother a mathematician, and among their novels and magazines were reams of scientific publications. In the wood-paneled study, we passed around great sheaves of papers for sorting, filling the air with dust.

My youngest sister put a pile of yellowing papers in front of me, and I started to leaf through the typewritten letters and scholarly articles. Then my eyes fell on the words fundamental breakthrough, spectacular, and revolutionary. Letters from some of the biggest names in physics fell out of the folders, in correspondence going back to 1979.

In this stack, I found, was evidence of a mystery. My grandfather had a theory, one that he believed to be among the most important work of his career. And it had never been published… (read more, My Grandfather Thought He Solved a Cosmic Mystery)

 

 

Recent Articles – Dec 05th, 2018

Ketoreductase Domain Dysfunction Expands Chemodiversity: Malyngamide Biosynthesis in the Cyanobacterium Okeania hirsuta

Structural Basis of Polyketide Synthase O-Methylation

Structural and Functional Studies of a gem-Dimethylating Methyltransferase from a trans-Acyltransferase Assembly Line

 

Recent Articles – Oct, 12th 2018

From ACS Central Science

Imaging Mass Spectrometry Reveals Crosstalk between the Fallopian Tube and the Ovary that Drives Primary Metastasis of Ovarian Cancer

oc-2018-00405y_0006

This is a great project and a great paper by Laura Sanchez group! A worthwhile reading.

From Chemical Reviews

Production and Synthetic Modifications of Shikimic Acid

From the Journal of Natural Products

cr-2018-00350j_0169

Matrine-Type Alkaloids from the Roots of Sophora flavescens and Their Antiviral Activities against the Hepatitis B Virus

np-2018-00576h_0006

Spatial Distribution of Collections Yielding Marine Natural Products

np-2018-002889_0002

Auranthine, a Benzodiazepinone from Penicillium aurantiogriseum: Refined Structure, Absolute Configuration, and Cytotoxicity

np-2018-001878_0011

Irpeksins A–E, 1,10-seco-Eburicane-Type Triterpenoids from the Medicinal Fungus Irpex lacteus and Their Anti-NO Activity

np-2017-00845c_0009

From the Journal of the American Chemical Society

Oriented-External Electric Fields Create Absolute Enantioselectivity in Diels–Alder Reactions: Importance of the Molecular Dipole Moment

ja-2018-08233m_0015

This seems to be an incredibly important breakthrough.

From Nature

First report of antimicrobial resistance pre-dates penicillin

This is a very interesting story.

How seventeenth-century sisters broke the mould on scientific illustration

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How to write a thorough peer review

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I highly reccomend the reading of this Nature paper. Well thought.

From Organic Letters

Stereodivergent Total Synthesis of Hapalindoles, Fischerindoles, Hapalonamide H, and Ambiguine H Alkaloids by Developing a Biomimetic, Redox-Neutral, Cascade Prins-Type Cyclization

ol-2018-02804y_0007

Theionbrunonines A and B: Dimeric Vobasine Alkaloids Tethered by a Thioether Bridge from Mostuea brunonis

ol-2018-02961m_0005

Synthesis and Characterization of Anguibactin To Reveal Its Competence To Function as a Thermally Stable Surrogate Siderophore for a Gram-Negative Pathogen, Acinetobacter baumannii

ol-2018-02789j_0006

Plagiochianins A and B, Two ent-2,3-seco-Aromadendrane Derivatives from the Liverwort Plagiochila duthiana

ol-2018-02888e_0005

From Angewandte Chemie International Edition

Chlorophyll Breakdown in a Fern—Discovery of Phyllobilin Isomers with a Rearranged Carbon Skeleton

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Thinking Outside the Box—Novel Antibacterials To Tackle the Resistance Crisis

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Computational Studies on Biosynthetic Carbocation Rearrangements Leading to Quiannulatene: Initial Conformation Regulates Biosynthetic Route, Stereochemistry, and Skeleton Type

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Total Syntheses of Asperchalasines A–E

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Genome Editing Reveals Novel Thiotemplated Assembly of Polythioamide Antibiotics in Anaerobic Bacteria

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Structure, Total Synthesis, and Biosynthesis of Chloromyxamides: Myxobacterial Tetrapeptides Featuring an Uncommon 6‐Chloromethyl‐5‐methoxypipecolic Acid Building Block

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From the European Journal of Organic Chemistry

Synthesis and biological evaluation of (modified) miuraenamides

From Chemistry World

Chemistry World is the dissemination journal edited by the Royal Society of Chemistry, UK. I consider some Chemistry World articles as of interest to the scientific community.

Wanted: chemistry’s next superstar – The drop in chemistry undergraduates highlights the need for more inspirational scientists

Time to rewrite the textbooks – How science corrects is an important lesson in the classroom

From folklore to pharmacy

Artificial intelligence seeks out new anticancer drugs – A combination of machine learning methods yields promising results for drug discovery

Novartis exit from antibiotics a setback for race against resistance

Derek Barton and shape-shifting molecules

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